Cytoscape 2.7.0 中的新功能

嵌套网络

现在一个节点可以引用另一个网络,这使我们能够在网络本身中捕获网络之间的关系。此功能包括用于嵌套网络输入/输出的新文件格式 (NNF),以及通过编辑器和右键菜单进行的直接嵌套网络编辑。此外还添加了一个视觉属性,用于控制嵌套网络的可视化效果。

新边缘类型

增加了几种介于实线和虚线之间的新边缘类型。

属性浏览器中的换行符和列表编辑

属性浏览器已更新,现在可以通过按“Enter”键添加换行符。同时启用了列表编辑功能。

自动标签换行

添加了一个新的视觉属性,用于设置标签的宽度。任何超出此宽度的标签都将自动换行。

箭头颜色可选锁定至边缘颜色

现在可以通过勾选 VizMapper 中“默认外观浏览器 (Default Appearance Browser)”的“依赖项 (Dependencies)”窗格中的复选框,将箭头颜色绑定到边缘颜色。这避免了必须分别为边缘、源箭头和目标箭头创建相同映射的麻烦。

CyCommandHandlers

在核心中添加了一种机制,以提供插件间的通信。

支持 BioPAX Level 3