如果双击 Cytoscape 的 Mac 安装程序 (.dmg) 时无法启动(例如,出现无法识别开发者的问题),这可能是因为它是早期版本,或者正在等待 Apple 开发者签名。
解决方案:右键点击 .dmg 文件并选择“打开”。这样您就可以强制打开该安装程序。
最近的 Mac OS 更新导致基于 OpenCL 的 Cytoscape 应用在某些机器上无法运行。如果是这种情况,您可以通过以下方法禁用 OpenCL:
将 disable-opencl.dummy 文件下载到您的 CytoscapeConfiguration 目录中。您可以从 Mac 的“个人文件夹”(Home)浏览到此目录。下载完成后,您的文件夹应该看起来如下图所示。
或者,如果您习惯使用终端,可以使用以下命令创建此文件:touch ~/CytoscapeConfiguration/disable-opencl.dummy
Cytoscape 是一个 Java 应用程序,需要一些第三方软件包才能正常运行。要测试您的系统,请先下载以下脚本。
这取决于您将上述脚本保存到了哪里。
您需要更改权限以使其可运行。对于 Linux,请将“mac.sh”更改为“linux.sh”。
几秒钟后,它应该会显示测试结果。对于 Linux,请将“mac.sh”更改为“linux.sh”。
这通常是“下载”文件夹或桌面
几秒钟后,它应该会显示测试结果。
如果检查程序显示您的机器已准备就绪,但仍无法运行 Cytoscape,这可能是个 Bug。请通过以下方式报告:
帮助 (Help) → 报告 Bug (Report a bug...)
或者,您可以直接通过导航栏上的 报告 Bug (Report a bug) 链接进行报告。
如果您从系统检查脚本中收到了错误消息,且无法自行解决问题,请在 Bioinformatics StackExchange 上搜索带有 Cytoscape 标签的问题,或发布新问题。